Protein–RNA interactions for Protein: O15091

KIAA0391, Mitochondrial ribonuclease P protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0391O15091 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0391O15091 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0391O15091 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0391O15091 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0391O15091 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0391O15091 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0391O15091 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0391O15091 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0391O15091 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0391O15091 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0391O15091 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0391O15091 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0391O15091 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0391O15091 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0391O15091 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0391O15091 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0391O15091 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0391O15091 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0391O15091 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIAA0391O15091 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIAA0391O15091 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIAA0391O15091 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0391O15091 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0391O15091 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0391O15091 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0391O15091 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0391O15091 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0391O15091 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms