Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD28O15084 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms