Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNMO15061 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNMO15061 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNMO15061 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNMO15061 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNMO15061 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNMO15061 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNMO15061 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNMO15061 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNMO15061 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNMO15061 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNMO15061 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNMO15061 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNMO15061 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNMO15061 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNMO15061 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNMO15061 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNMO15061 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNMO15061 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNMO15061 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNMO15061 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNMO15061 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNMO15061 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNMO15061 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNMO15061 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNMO15061 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNMO15061 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNMO15061 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNMO15061 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNMO15061 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNMO15061 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNMO15061 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNMO15061 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNMO15061 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNMO15061 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNMO15061 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNMO15061 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNMO15061 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNMO15061 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNMO15061 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNMO15061 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNMO15061 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNMO15061 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNMO15061 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNMO15061 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
SYNMO15061 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNMO15061 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNMO15061 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNMO15061 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNMO15061 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNMO15061 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNMO15061 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNMO15061 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNMO15061 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNMO15061 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNMO15061 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNMO15061 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNMO15061 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNMO15061 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNMO15061 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNMO15061 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNMO15061 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNMO15061 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNMO15061 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNMO15061 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNMO15061 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNMO15061 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNMO15061 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNMO15061 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNMO15061 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNMO15061 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNMO15061 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNMO15061 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNMO15061 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNMO15061 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNMO15061 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNMO15061 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNMO15061 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms