Protein–RNA interactions for Protein: K7EIQ3

ZNF561-AS1, Uncharacterized protein ZNF561-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF561-AS1K7EIQ3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF561-AS1K7EIQ3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF561-AS1K7EIQ3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms