Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC01387J3KSC0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01387J3KSC0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms