Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms