Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms