Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms