Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms