Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSDA5PKW4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms