Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms