Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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