Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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