Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HJURPQ8NCD3 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.2 ms