Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP261-201ENST00000410948 278 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SNHG26-201ENST00000415611 1099 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC002511.1-201ENST00000428426 1000 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC108448.2-201ENST00000431546 730 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SNHG14-204ENST00000441592 608 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPL34P17-201ENST00000472160 347 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP10-201ENST00000489946 466 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC106872.7-201ENST00000508621 312 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC068898.2-201ENST00000514425 597 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC011676.1-201ENST00000517658 397 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC124290.2-201ENST00000519431 286 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 IGLVIV-59-201ENST00000520218 250 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC008663.3-201ENST00000520300 457 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AF279873.3-201ENST00000523063 766 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 B2M-202ENST00000544417 933 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC006927.1-201ENST00000544818 498 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC104041.1-201ENST00000560054 569 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL049634.2-203ENST00000564763 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 OR1D5-201ENST00000575751 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC137056.1-202ENST00000575772 753 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC117569.1-202ENST00000581532 557 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MIR5008-201ENST00000584300 94 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RN7SL262P-201ENST00000584590 294 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC022149.1-201ENST00000596032 609 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC010320.1-201ENST00000599775 578 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPS16-207ENST00000601655 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC097534.2-201ENST00000609153 751 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 NBPF15-206ENST00000581897 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF438-203ENST00000375311 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CH17-340M24.3-201ENST00000360656 598 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TIPRL-201ENST00000367830 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms