Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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CTXN3Q4LDR2 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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CTXN3Q4LDR2 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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CTXN3Q4LDR2 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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CTXN3Q4LDR2 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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CTXN3Q4LDR2 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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CTXN3Q4LDR2 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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