Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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CHD4Q14839 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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CHD4Q14839 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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