Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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