Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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