Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms