Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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SP140Q13342 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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SP140Q13342 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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SP140Q13342 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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SP140Q13342 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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SP140Q13342 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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SP140Q13342 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SP140Q13342 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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SP140Q13342 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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SP140Q13342 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SP140Q13342 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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SP140Q13342 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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SP140Q13342 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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