Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 GSTA10P-201ENST00000412182 576 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 PPP4R2-207ENST00000495566 559 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC024257.1-201ENST00000547523 566 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 KRT73-AS1-203ENST00000552364 3808 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC006441.3-201ENST00000580121 456 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC005518.2-201ENST00000603254 282 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NUGGC-201ENST00000413272 3887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 XIRP2-202ENST00000409043 3292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 PDE7A-202ENST00000396642 2986 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 PIWIL3-204ENST00000533313 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LMLN-202ENST00000332636 1812 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OR6N2-201ENST00000339258 954 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 FCAR-205ENST00000391723 754 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RPSAP72-201ENST00000407020 358 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
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