Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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