Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 TTC21A-205ENST00000440121 3941 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ARHGAP11A-202ENST00000543522 3152 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 REG3G-203ENST00000409471 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL136454.1-201ENST00000443181 466 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RPL12P40-201ENST00000467028 488 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RN7SL153P-201ENST00000486501 292 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC068134.3-201ENST00000513620 788 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC005387.1-201ENST00000597837 352 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 pRNA.3-201ENST00000615048 90 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 NEK10-201ENST00000295720 2871 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SERPINA1-208ENST00000448921 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 STARD4-212ENST00000512160 3500 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 TROVE2-201ENST00000367441 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 CU633906.2-201ENST00000624576 2257 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 CD22-201ENST00000085219 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 LINC00954-202ENST00000449086 2995 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ANKS1B-213ENST00000549025 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 LIG4-204ENST00000611712 4180 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 MMGT1-201ENST00000305963 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 NR1I2-203ENST00000466380 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AC093768.1-201ENST00000505987 2173 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 HBP1-208ENST00000468410 2704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 SNORA30-201ENST00000384028 129 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 FCAR-205ENST00000391723 754 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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