Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 PRLR-213ENST00000514088 1440 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2P78314 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2P78314 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2P78314 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2P78314 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2P78314 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 REG1CP-205ENST00000444841 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 CDH18-201ENST00000274170 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 LINC01805-201ENST00000436433 572 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 LINC00881-201ENST00000467995 589 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RN7SL153P-201ENST00000486501 292 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2P78314 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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