Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRZ1P23471 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms