Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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VAX2Q9UIW0 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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VAX2Q9UIW0 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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VAX2Q9UIW0 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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VAX2Q9UIW0 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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