Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms