Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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ANKRD42Q8N9B4 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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ANKRD42Q8N9B4 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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ANKRD42Q8N9B4 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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ANKRD42Q8N9B4 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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ANKRD42Q8N9B4 CCDC196-207ENST00000636229 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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ANKRD42Q8N9B4 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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