Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms