Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PCM1Q15154 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PCM1Q15154 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PCM1Q15154 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PCM1Q15154 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PCM1Q15154 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PCM1Q15154 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PCM1Q15154 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PCM1Q15154 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PCM1Q15154 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PCM1Q15154 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PCM1Q15154 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PCM1Q15154 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PCM1Q15154 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PCM1Q15154 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PCM1Q15154 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms