Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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