Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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