Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
NME3Q13232 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.56
NME3Q13232 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NME3Q13232 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
NME3Q13232 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NME3Q13232 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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