Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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GPS1Q13098 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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GPS1Q13098 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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