Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms