Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GPC5P78333 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPC5P78333 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPC5P78333 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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