Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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PGGT1BP53609 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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PGGT1BP53609 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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PGGT1BP53609 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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PGGT1BP53609 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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PGGT1BP53609 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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