Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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CASQ1P31415 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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CASQ1P31415 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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CASQ1P31415 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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CASQ1P31415 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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CASQ1P31415 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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CASQ1P31415 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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CASQ1P31415 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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