Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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