Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms