Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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ECM1Q16610 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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ECM1Q16610 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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