Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CD34-201ENST00000310833 8246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 VCAN-208ENST00000512590 5923 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 GPR161-201ENST00000271357 7806 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SBF2-201ENST00000256190 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MYH15-201ENST00000273353 7074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PCDHB1-201ENST00000306549 8210 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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HERC1Q15751 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DIO2-201ENST00000422005 6272 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 FBN2-204ENST00000508053 11132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 VWA5A-205ENST00000456829 4388 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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