Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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