Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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TCIRG1Q13488 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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TCIRG1Q13488 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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