Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ACSL1-212ENST00000622937 4103 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 GAPVD1-204ENST00000394083 4747 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ZNF317-201ENST00000247956 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ADIPOQ-AS1-201ENST00000422718 3443 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RAB5B-210ENST00000553116 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 PTPN3-204ENST00000446349 8630 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 SH3D19-204ENST00000427414 2656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ZNF182-201ENST00000376943 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 UTP23-201ENST00000309822 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 EEF1A1P5-201ENST00000436459 1389 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 KCTD6-201ENST00000355076 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 PHLPP2-206ENST00000568954 8317 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ARHGAP11A-202ENST00000543522 3152 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 KIF6-208ENST00000538893 2386 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 PFKFB1-203ENST00000545676 1591 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 TTC21A-205ENST00000440121 3941 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 GPR161-201ENST00000271357 7806 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 PLEKHA5-215ENST00000539256 3357 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 TNR-202ENST00000367674 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ZNF334-201ENST00000347606 3890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
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MKRN3Q13064 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL450124.1-201ENST00000376401 353 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
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MKRN3Q13064 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
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MKRN3Q13064 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
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MKRN3Q13064 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
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MKRN3Q13064 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
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MKRN3Q13064 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
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MKRN3Q13064 IGKV1OR1-1-201ENST00000613775 347 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
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MKRN3Q13064 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CSRNP3-203ENST00000409420 2545 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CNOT4-207ENST00000451834 3507 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 FAM186A-204ENST00000543111 8200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 KNG1-202ENST00000287611 1720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MAGEE1-201ENST00000361470 3630 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 WDR78-203ENST00000371026 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 NUMA1-232ENST00000613205 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 LINC01234-202ENST00000547963 2088 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 NUDT13-201ENST00000349051 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MAP3K13-203ENST00000424227 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 OAS2-207ENST00000620097 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 LTBP1-201ENST00000402934 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MACROD2-202ENST00000378058 4025 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 SMG1P1-202ENST00000309865 4223 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
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