Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CAST-222ENST00000508579 1758 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 DTHD1-201ENST00000357504 3203 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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