Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TMIGD3P0DMS9 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TMIGD3P0DMS9 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TMIGD3P0DMS9 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TMIGD3P0DMS9 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMIGD3P0DMS9 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms