Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TTF2Q9UNY4 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms