Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 RN7SL251P-201ENST00000464175 297 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 OR10J9P-201ENST00000511932 987 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SCG3Q8WXD2 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SCG3Q8WXD2 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SCG3Q8WXD2 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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